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乳清タンパク中の成分についても両者は異なり、大きな違いは母乳にはβ-ラクトグロブリンが含まれていないこと、ラクトフェリンの含量が多いことである。

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次に牛乳については、牛乳のタンパク質に含まれるカゼインとβ－ラクトグロブリンが代表的なアレルゲンである。これらの成分は羊やヤギ、その他の動物のミルクに共通に含まれる。